Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTF1Q15361 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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