Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms