Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms