Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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