Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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