Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CUL4AQ13619 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CUL4AQ13619 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL4AQ13619 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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