Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HDAC1Q13547 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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