Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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