Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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