Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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