Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TCOF1Q13428 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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