Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDC16Q13042 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDC16Q13042 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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