Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms