Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERFP50548 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERFP50548 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERFP50548 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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