Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRGP23470 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRGP23470 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms