Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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