Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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