Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CFAP73A6NFT4 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms