Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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