Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms