Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Q1T7F1 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms