Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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