Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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