Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPE65Q16518 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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RPE65Q16518 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RPE65Q16518 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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