Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HERC1Q15751 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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