Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SYCP1Q15431 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SYCP1Q15431 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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