Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
UBE3CQ15386 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms