Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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RFTN1Q14699 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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RFTN1Q14699 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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RFTN1Q14699 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
RFTN1Q14699 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RFTN1Q14699 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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