Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CSHL1Q14406 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CSHL1Q14406 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms