Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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