Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
APOFQ13790 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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