Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms