Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRQ13535 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRQ13535 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRQ13535 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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