Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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