Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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TCOF1Q13428 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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TCOF1Q13428 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TCOF1Q13428 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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TCOF1Q13428 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TCOF1Q13428 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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