Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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