Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATMQ13315 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ATMQ13315 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATMQ13315 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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