Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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