Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF2Q12933 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF2Q12933 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF2Q12933 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF2Q12933 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF2Q12933 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TRAF2Q12933 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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TRAF2Q12933 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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TRAF2Q12933 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF2Q12933 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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