Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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