Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms