Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TTPAP49638 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TTPAP49638 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TTPAP49638 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TTPAP49638 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms