Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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PTPRMP28827 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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