Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP35Q9P2H5 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP35Q9P2H5 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP35Q9P2H5 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP35Q9P2H5 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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