Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP4Q9P0V3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SH3BP4Q9P0V3 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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