Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXC10Q9NYD6 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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