Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms