Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FANCFQ9NPI8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms