Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
UHRF1Q96T88 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms