Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMG1Q96Q15 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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